Die Forschungsaktivitäten des ZfKJ lassen sich in zehn größere Forschungsschwerpunkte differenzieren, die sich aus drittmittelfinanzierten Projekten über die Jahre entwickelt haben und auch eine Instrumentenentwicklung sowie Transferaktivitäten einschließen. Darüber hinaus wurden am ZfKJ eine Reihe internationaler Projekte (zumeist EU-Drittmittelprojekte) realisiert
Resilienz – Kindliche Entwicklung und seelische Gesundheit (Resilienz) und Homepage
HeVeKi - Herausforderndes Verhalten bei Kindern und Jugendlichen (Herausforderndes Verhalten in Kitas (HeVeKi)
PNO - Präventionsnetzwerk Ortenaukreis (Präventionsnetzwerk Ortenaukreis (PNO) und Homepage
GInA – Gestaltung von Interaktionsgelegenheiten im Alltag (Gestaltung von Interaktionsgelegenheiten im Alltag (GInA) und Homepage
InkluKiT – Inklusionskompetenz in KiTa-Teams (Inklusion)
InkoFeed - Kompetenzbasierte Prüfungs- und Feedbackverfahren
Begegnungen zwischen Jung und Alt https://www.eh-freiburg.de/intergenerative-begegnungen/ - Filmhinweis: https://www.zdf.de/gesellschaft/plan-b/plan-b-trubel-im-altenheim-100.html
Multiprofessionelle Teams (Multiprofessionelle Teams)
Gewaltentstehung, Umgang mit gewalttätigem Verhalten, Gewaltprävention an Schulen (Gewaltentstehung, Umgang mit gewalttätigem Verhalten, Gewaltprävention an Schulen)